Triết lý giáo dục tại Thánh Kinh Thần Học Viện được thiết lập dựa trên nhận thức rằng Hội Thánh được tạo dựng một cách thuộc linh trong Đấng Christ. Sự huấn luyện thực hành và kỷ luật giữa thần học và khoa học xã hội giúp chuẩn bị cho sinh viên phục vụ như những mục sư và giáo sư dạy Lời của Đức Chúa Trời, những nhà lãnh đạo có trách nhiệm với Hội Thánh Việt Nam tại Việt Nam và hải ngoại.
Mục tiêu của Thánh Kinh Thần Học Viện là chuẩn bị những người nam, người nữ cho mục vụ của Phúc Âm Đức Chúa Jêsus Christ và sự phát triển của Vương quốc Đức Chúa Trời giữa vòng những Hội Thánh Việt Nam khắp thế giới. Để đạt được mục tiêu chung nầy, Viện đã đề ra những mục tiêu sau đây mà những sinh viên tốt nghiệp cần phải nhận biết trong các chương trình học của mình:
1. Có năng lực trong những kỹ năng mục vụ, bao gồm truyền giáo, mở Hội Thánh mới, giảng dạy, quản trị, tư vấn, và những mối quan hệ cá nhân.
2. Trau dồi một lòng trung thành cá nhân và tập thể một cách sâu nhiệm.
3. Nhận biết và hiểu những nghiên cứu và thần học Thánh Kinh.
4. Có một triết lý căn bản về sự phát triển mục vụ dựa trên sự nghiên cứu những tài liệu thần học và những tài liệu khoa học xã hội được chấp nhận.
5. Có những kinh nghiệm mục vụ được hướng dẫn như huấn luyện thực hành, thực tập, v.v…
6. Có tri thức, sự hiểu, và kinh nghiệm để phát triển một mục vụ thích ứng và hiệu quả giữa vòng người Việt Nam.
7. Trở nên những Mục sư hiệu quả cho các Hội Thánh tại Hoa Kỳ, tại Việt Nam, và khắp nơi trên thế giới.
Viện nhận thức rằng, Mục sư không chỉ được giáo dục và huấn luyện. Sự phát triển kỷ luật tự giác, một đời sống trung thành, sự khát khao Chúa, và lòng trắc ẩn đối với con người không thể dạy được, nhưng những đức tính nầy cần được làm gương và khích lệ.